AutoMKV es una versión reducida de MKVmagic, que soporta diversos formatos tanto de entrada como de salida. Es ideal para los usuarios menos expertos que deseen sacar provecho de esta utilidad sin complicarse la vida con las innumerables posibilidades de la versión completa.

AutoMKV soporta los siguientes formatos de vídeo como entrada: DVD (IFOs y VOBs tanto en disco duro como en la unidad de DVD), MPEG-2 (y todos sus derivados), MPEG-4 (DivX, Xvid, H.264, VC1, etc), WMV y cualquier otro formato que pueda ser reproducido en el reproductor estándar de Windows.

Para la salida, AutoMKV soporta los siguientes códecs de vídeo: XVID, H.264 y WMV. El programa también es compatible con los formatos Matroska, MP4, WMV y AVI / DIVX.